Вопрос по работе виртмашины под прозрачно торифицированным юзером

В силу примеров данных здесь, на виртмашине нужно указать IP и GW, а на физической запустить Tor-клиент, настроить его, и поднять редиректы средствами fw. Иначе работать не будет.

Если машина настроена на сетевое соединение через bridge (и машина будет иметь свой ip в той же локальной сети, что и физмашина), а не через nat, будет ли трафик заворачиваться в tor?

Если IP из того же диапазона адресов, то траф пойдёт на физический gw провайдера, буде он прописан. Физический IP физической машины должен быть GW для виртуальной машины: так и только так. NAT не фигурирует в настройках, но виртуальная машина настраивается так же, как будто она за NAT'ом, делаемым для неё физ.машиной (но не gw'ем провайдера!).

машина настроена на сетевое соединение через bridge

Bridge, насколько я помню, прозрачно перекидывает пакеты из одной сети в другую, и не более того. Вот и смотрите в какую подсеть он перекидывает пакеты с виртуалки: в реальную LAN или "свою". В первом случае виртуалка будет работать так, как будто это отдельная машина в той же LAN, во-втором – всё будет резаться пока на физической не будет согласованно прописана маршрутизация трафика с виртуалки, т.е. "будет резаться".